如果多功能净化柱的离子交换柱上残留有聚合物不挥发物化学物质，则在程序升温时容易产生基线漂移，因为这些化学物质保留较强，在柱中移动缓慢，可采用重新老化的方法将这种强保留组分从柱上赶出，但这种方法增加了固定不动液空气氧化的可能性；此外，还可采用溶剂冲洗多功能净化柱的离子交换柱(冲洗前请阅读柱子的使用注意事项，以便选择合适的溶剂)；还可安装保护柱，以防止出现问题。若多功能净化柱进样器因污染而导致基线漂移，则可通过更换进样垫、衬管和密封圈来解决，同时用溶剂冲洗进样口，维修完毕后，用一段熔融石英管将多功能净化柱进样器与检测器连接，进一针空样，确认多功能净化柱进样器已清洁。